Für alle Säulen in der Ionenchromatographie ist die Kapazität ein wichtiges Kriterium bei der Wahl der Säule. Die Kapazität gibt die Anzahl der funktionellen Gruppe pro Einheit an (Gewicht oder Säule). Je größer die Kapazität ist, umso stärker hält die Phase Ionen bzw. Analyten zurück. Eine höhere Kapazität hat aber auch eine höhere Ionenkonzentration in der mobilen Phase zu Folge, damit die Analyten wieder eluieren. Dies kann nachteilig für einige Detektionsmethoden sein. Eine geringe Kapazität führt zu einer geringen Beladbarkeit, daher sollte ein Kompromiss zwischen Beladbarkeit und Detektion getroffen werden.
Meist wird die Säulenwahl durch die Analyten festgelegt. Je nachdem, ob Kationen oder Anionen analysiert werden sollen, fällt die Wahl dementsprechend auf Anionen oder Kationensäulen. Die Art der Anwendung schränkt auch wiederum die Auswahl der Säule ein, da bestimmte Säulen für bestimmte Applikationen verwendet werden (die Hersteller haben meist eine große Datenbank mit Applikationen). Die Wahl der Säule wiederum legt auch den Eluenten und die Suppression fest.
- Auswahl der passenden Säule am besten über die Applikation