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Oligonukleotide
Oligonukleotide sind kurze, synthetisch hergestellte DNA- oder RNA-Sequenzen, die aus wenigen Nukleotiden bestehen. Sie spielen eine wichtige Rolle in der molekularen Biologie und Medizin, insbesondere in der Genforschung, Diagnostik und Therapie. In der Medizin werden Oligonukleotide vor allem als Therapeutika eingesetzt, um spezifische Gene zu beeinflussen. Dazu gehören Antisense-Oligonukleotide, die die Genexpression unterdrücken, und siRNA (small interfering RNA), die gezielt mRNA abbauen, um die Synthese krankheitsverursachender Proteine zu verhindern. Diese Technologien bieten vielversprechende Ansätze zur Behandlung genetischer Erkrankungen, Krebs und viraler Infektionen.
Die Analyse von Oligonukleotiden ist von entscheidender Bedeutung, da sie die Qualität, Reinheit und Wirksamkeit dieser Moleküle in biomedizinischen Anwendungen sicherstellt. Präzise Analysen ermöglichen es, Sequenzfehler zu erkennen, die Funktionalität und Stabilität der Oligonukleotide zu überprüfen und sicherzustellen, dass sie die gewünschte biologische Wirkung entfalten. Besonders in der therapeutischen Anwendung, wie bei Antisense-Oligonukleotiden oder siRNA, ist eine genaue Charakterisierung notwendig, um unerwünschte Nebenwirkungen und eine ineffektive Behandlung zu vermeiden. Methoden wie Massenspektrometrie, HPLC und Sequenzierung spielen dabei eine zentrale Rolle.
Technische Daten
Unterschiede zwischen Nukleotiden, Oligonukleotiden und DNA/RNA
Die Unterschiede zwischen der Oligonukleotid-, Nukleotid- und DNA/RNA-Analyse mittels HPLC liegen in den Zielmolekülen und den Analysemethoden:
- Oligonukleotid-Analyse: Hier werden kurze Ketten von Nukleotiden (Oligonukleotide) analysiert. Oft wird Reversed-Phase HPLC (RP-HPLC) eingesetzt, um verschiedene Oligonukleotide basierend auf ihrer Länge und chemischen Modifikationen zu trennen.
- Nukleotid-Analyse: Einzelne Nukleotide (ATP, GTP, CTP, UTP etc.) werden analysiert. Hier wird häufig Anionenaustausch-HPLC verwendet, um die Nukleotide anhand ihrer Ladung und Größe zu trennen.
- DNA/RNA-Analyse: Bei der Analyse von größeren DNA- oder RNA-Molekülen wird HPLC zur Reinheitsprüfung und Quantifizierung genutzt. Spezielle Säulen und Methoden wie Größenausschluss-HPLC oder Affinitätschromatographie können verwendet werden, um intakte Nukleinsäuren oder ihre Fragmente zu trennen.
Applikationen
Oligonukleotid Trennung mit guter Peakform mit AMT HALO Oligo C18
- Trennung von Oligonukleotiden bis zu 60 Basen (60 mer) bei guter Peakform
Peakidentitäten
1. 10 mer 2. 15 mer 3. 20 mer 4. 25 mer 5. 30 mer 6. 40 mer 7. 50 mer 8. 60 mer * Tris HCl/EDTA
Säule
AMT: HALO 120Å OLIGO C18, 2.7µm, 50x2.1mm
Competitor: OLIGO 130Å C18, 1.7µm, 50x2.1mm
Downloads
Hersteller Übersicht
AMT
HPLC - Reversed Phase:
- HALO Oligo, 2.7µm
GL Sciences
HPLC - Reversed Phase:
- ProteoSil 200-C18, 3µm
- MonoClad C18-HS
- InertSustainSwift C18, 3µm
HPLC - Mixed-Mode:
- InertSustain AX-C18, 3µm
UHPLC - HILIC:
- InertSustain Amide, 1.9µm
- Gl Sciences InertSustain Amide Analysis of Oligonucleotides
- GL Sciences InertsSustain AX-C18 Analysi of Oligonucleotides
- GL Sciences InertSustain AX-C18 Analysis of Oligonucleotides Metal Free Hardware
- GL Sciences InertSustainSwift C18 Analysis of Oligonucleotides
- GL Sciences ProteoSil 200-C18 Analysis of Oligonucleotides
- GL Sciences MonoClad C18-HS Analysis of DNA Oligomers
- GL Sciences MonoClad C18-HS Analysis of Ribonucleic Acids (ssRNA)
Hamilton
HPLC - Reversed Phase:
- PRP-C18, 5µm
Imtakt
HPLC - Mixed-Mode:
- Intrada Organic Acid, 3µm
- Scherzo SW-C18, 3µm
HPLC - Reversed Phase:
- Unison UK-C18, 3µm
- Unison US-C18, 5µm
UHPLC - Reversed Phase:
- Presto FF-C18, 2µm
- Imtakt Intrada Organic Acid Deoxyoligonucleotides
- Imtakt Intrada Organic Acid Oligonucleotides (Oligothymidylic Acid)
- Imtakt Intrada Organic Acid Oligonucleotides (Oligothymidylic Acid)
- Imtakt Intrada Organic Acid Oligonucleotides (Oligothymidylic Acid)
- Imtakt Presto FF-C18 Deoxyoligonucleotides
- Imtakt Presto FF-C18 Oligonucleotides (Oligothymidylic Acid)
- Imtakt Scherzo SW-C18 Oligonucleotides
- Imtakt Unison UK-C18 Deoxyoligonucleotides
- Imtakt Unison US-C18 Oligonucleotides
Macherey-Nagel
HPLC - IEX:
- Nucleogel SAX
HPLC - HILIC:
- Nucleodur HILIC, 5µm
HPLC - Reversed Phase:
- Nucleosil C18, 5µm
- Macherey-Nagel Nucleogel SAX Separation of Synthetic Oligonucleotides
- Macherey-Nagel Nucleosil C18 5-Dimethoxytritylated Oligonucleotides
- Macherey-Nagel Nucleosil C18 Oligothymidine Phosphates
- Macherey-Nagel Nucleosil C18 Separation of dA3TA8 and its Phosphorylated Derivatives
- Macherey-Nagel Nucleodur HILIC Cyclobutane Pyrimidine Dimer Nucleotides
Nacalai Tesque
HPLC - Reversed Phase:
- Cosmosil C18-EB, 3µm
- Cosmocore PBr, 2.6µm
- Cosmocore C18, 2.6µm
- Cosmocore Cholester, 2.6µm
- Naclai Tesque Cosmocore C18, Cholester, PBr Oligonucleotides (dA) 19S10
- Naclai Tesque Cosmocore C18, Cholester, PBr Oligonucleotides (dT) 19-S10
- Naclai Tesque Cosmocore C18, Cholester, PBr Oligonucleotides (dT) 19-S17,18
- Naclai Tesque Cosmocore PBr Oligonucleotides (dT) 19
- Naclai Tesque Cosmocore PBr Oligonucleotides (dA)
- Naclai Tesque Cosmocore PBr Oligonucleotides (dA) 19
- Naclai Tesque Cosmosil C18-EB Oligonucleotides
- Naclai Tesque Cosmosil C18-EB Oligonucleotides (dA) 20 Ladder
- Naclai Tesque Cosmosil C18-EB Oligonucleotides (dA) Ladder
- Naclai Tesque Cosmosil C18-EB Oligonucleotides (dT)
- Naclai Tesque Cosmosil C18-EB Oligonucleotides (dT)
- Naclai Tesque Cosmosil C18-EB Oligonucleotides
- Naclai Tesque Cosmosil C18-EB Oligonucleotides
Nouryon - Kromasil
UHPLC - Reversed Phase:
- Kromasil 100 Phenyl, 2.5µm
- Kromasil 100 C4, 2.5µm
- Kromasil 100 C18, 2.5µm
Osaka Soda
UHPLC - Reversed Phase:
- Capcell PAK C18, IF, 1.8µm
Sepax
HPLC - IEX:
- Proteomix SAX, 3µm
- Proteomix SAX, 5µm
HPLC - SEC:
- Zenix SEC-300, 3µm
- Zenix SEC-150, 3µm
- Zenix-C SEC-150, 3µm
- Zenix-C SEC-100, 3µm
HPLC - Reversed Phase:
- Bio-C18, 5µm
UHPLC - Reversed Phase:
- GP-C18, 1.8µm
- Sepax Bio-C18, Proteomix SAX Oligonucleotide Analysis
- Sepax Proteomix SAX Separation od Oligonucleotide and its degarded Fragments
- Sepax Proteimix SAX Separation of Oligonucleotides and its Impurities
- Sepax Proteomix SAX Short RNA Oligonucleotides
- Sepax Zenix SEC, Zenix-C, Proteomix RP, Proteomix SAX Oligonucleotide Separation
- Sepax Zenix-C SEC-100 Short Oligonucleotides Analysis
- Sepax Proteomix SAX Oligonucleotide Separation
Shimadzu
UHPLC - Reversed Phase:
- Shim-pack Scepter Claris C18, 1.9µm
- Shim-pack Scepter C18, 1.9µm
- Shim-pack Scepter HD-C18, 1.9µm
HPLC - Reversed Phase:
- Shim-pack Scepter C18, 5µm
HPLC - IEX:
- Shim-pack Bio IEX Q-NP, 5µm
- Shimadzu Oligonucleotide Therapeutics Solution Guide
- Shimadzu Shim-pack Scepter Claris C18 Simple Analysis of Impurities in Oligonucleotide Therapeutics
- Shimadzu Shim-pack Bio IEX Q-NP Analysis of Synthesized Oligonucleotides
- Shimadzu Shim-pack BIO IEX Q-NP Oligonucleotides Analysis
- Shimadzu Shim-pack Scepter Claris C18 Oligonucleotide Characterization for Quality Control
- Shimadzu Shim-pack Scepter Claris C18 An Oligonucleotide Impurity Analysis Workflow
- Shimadzu Shim-pack Scepter HD-C18 In-Pair Reversed Phase Separation and Identification of Oligonucleotides
- Shimadzu Shim-pack Scepter C18 Rapid UHPLC Analysis of DNA (12mer) and its Impurities
- Shimadzu Shim-pack Scepter Claris C18 Analysis of Synthetic DNA
- Shimadzu Shim-pack Scepter Claris C18 Qualitative Analysis of Synthetic DNA
Shodex
HPLC - HILIC:
- HILICpak VN-50 1D
- HILICpak VN-50 2D
- Shodex HILICpak VN-50 1D High Sensitive Analysis of Synthetic Oligo-DNA
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of 10 - 50mer Oligo DNAs
- Shodex HILICpak VN-50 2D LC/UC/MS Analysis of Oligo DNA
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of Oligo DNAs
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of Oligonucleotides and their Impurities
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of Oligonucleotides and their Impurities Truncated Oligonucleotides
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of Oligonucleotides and their Impurities Base Alteration
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of Phosphorotioated Oligo DNA
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of 2'-OMe and 2'-MOE Modified Phosphorotioated Oligo DNA
- Shodex HILICpak VN-50 2D Analysis of Various Oligonucleotides
Thermo
HPLC - Reversed Phase:
- DNAPac RP, 4µm
Tosoh
HPLC - IEX:
- TSKgel DEAE-3SW, 10µm
Waters
UHPLC - Reversed Phase:
- ACQUITY UPLC Oligonucleotide BEH C18, 1.7µm
- ACQUITY Premier Oligonucleotide BEH C18, 1.7µm
- ACQUITY Premier CSH, 1.7µm
- XBridge Oligonucleotide BEH C18, 2.5µm
- XTerra MS C18, 2.5µm
Probenvorbereitung:
- OASIS HLB SPE
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 Developing a Novel, Integrated LC-MS Workflow for High-Resolution Monitoring and Characterization of Oligonucleotides
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 Rapid Analysis of Synthetic mRNA Cap Structure Using Ion-Pairing RPLC
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 UPLC/MS Analysis of Interfering RNA Oligonucleotides
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 Real-Time Analysis of RNAI Duplexes
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 UPLC Synapt MS/MS Method for Structural Characterization of siRNA Oligonucleotides
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 Enhanced Resolution for Longer Oligonucleotide Analytes
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 Sensitive Bioanalysis of Antisense Oligonucleotides of Various Lengths and Modifications
- Waters Application Notebook Oligonucleotides
- Waters OASIS HLB Purification of DNA Oligonucleotides
- Waters OASIS HLsalting of DNA OligonucleotidesB De
- Waters XBridge Oligonucleotide BEH C18 HPLC and UPLC Columns for the Analysis of Oligonucleotides
- Waters XBridge Oligonucleotide BEH C18 Semi-preparative Scale Single-stranded RNA Purification
- Waters XTerra MS C18 Quality Control of Synthetic Oligonucleotides
- Waters XTerra MS C18 RP-HPLC Method for Purification of Dually-Labeled Synthetic Oligonucleotides
- Waters XTerra MS C18 LC/MS Analysis of Synthetic Oligonucleotides
- Waters XTerra MS C18 RP-HPLC Method for the Purification of Labeled Synthetic Oligonucleotides
- Waters XTerra MS C18 HPLC Purification of Long Synthetic Oligonucleotides
- Waters XTerra MS C18 Separation of RNA Oligonucleotides
- Waters XTerra Oligonucleotides Purification Applications Notebook
- Waters ACQUITY Oligonucleotide BEH C18 Real-Time Analysis of RNAI Duplexes
- Waters ACQUITY Premier CSH LC-MS Analysis of siRNA, Single Guide RNA and Impurities
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